Иоанно-Богословская церковь — памятник архитектуры XVII века — первоначально была деревянной, а в 1693 году построено каменное здание. Здание церкви со времени строительства несколько раз подвергалась переделкам, но в общем виде оно до наших дней сохранило свою самобытность.
Эта церковь перенесла тяжелые времена в эпоху «воинствующего безбожия». Верующие до конца отстаивали свое право на веру и на эту церковь, смело выступали против произвола властей.
Иоанно-Богословская церковь была закрыта в начале 1930-х гг. и временно передана под административное учреждение.
Затем храм временно возвращался верующим и был вновь закрыт в 1938 г. В эпоху перестройки это была единственная действующая церковь в городе. В настоящее время собор является главным в Саранской и Мордовской епархии.